Динамически формируемые параллельные среды в условиях грид-полигоноа: проблемы и решения

Авторы

  • В.М. Волохов Институт проблем химической физики РАН
  • Д.А. Варламов Институт проблем химической физики РАН
  • А.В. Пивушков Институт проблем химической физики РАН
  • Н.Ф. Сурков Институт проблем химической физики РАН
  • Д.А. Варламов Институт экспериментальной минералогии имени академика Д.С. Коржинского РАН (ИЭМ РАН)

Ключевые слова:

распределенные вычисления, грид, виртуализация, MPI, вычислительная и квантовая химия, GAMESS-US

Аннотация

Статья посвящена анализу проблем выполнения сложно сконфигурированных параллельных прикладных пакетов в распределенных средах и описанию некоторых способов разрешения подобных проблем. Описаны методы создания и запуска в различных грид-средах (gLite, Unicore, Globus GT4) динамически формируемых ("виртуальных") параллельных сред исполнения для обеспечения запуска параллельных прикладных задач. Разработанные методы позволяют запускать сложные, требующие предустановки и настройки кластера, параллельные приложения на не сконфигурированных заранее произвольных ресурсах грид-полигонов. Приведены примеры реализации данного метода для квантово-химического пакета GAMESS-US на различных грид-полигонах в условиях всех трех вышеупомянутых сред. Работа выполнена при поддержке РФФИ, грант № 11-07-00686-a. Статья подготовлена по материалам доклада авторов на международной научной конференции «Параллельные вычислительные технологии» (ПаВТ-2011; http://agora.guru.ru/pavt2011).

Авторы

В.М. Волохов

Институт проблем химической физики РАН
проспект академика Семенова, 1, 142432, Черноголовка
• заведующий отделом

Д.А. Варламов

Институт проблем химической физики РАН
проспект академика Семенова, 1, 142432, Черноголовка
• старший научный сотрудник

А.В. Пивушков

Институт проблем химической физики РАН
проспект академика Семенова, 1, 142432, Черноголовка
• старший научный сотрудник

Н.Ф. Сурков

Институт проблем химической физики РАН
проспект академика Семенова, 1, 142432, Черноголовка
• старший научный сотрудник

Д.А. Варламов

Институт экспериментальной минералогии имени академика Д.С. Коржинского РАН (ИЭМ РАН)
ул. Академика Осипьяна, 4, 142432, Черноголовка
• старший научный сотрудник

Библиографические ссылки

  1. Волохов В.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В., Покатович Г.А., Сурков Н.Ф. Технологии ГРИД в вычислительной химии // Вычислительные методы и программирование. 2010. 11, № 1. 175-182.
  2. Волохов В.М., Варламов Д.А., Сурков Н.Ф., Пивушков А.В. Виртуальные вычислительные среды: использование на GRID полигонах // Вестник ЮУрГУ. Cер. Математическое моделирование и программирование. 2009. № 17 (150). Вып. 3. 24-35.
  3. Варламов Д.А., Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф. Виртуализация параллельных приложений квантовой химии для запуска на ресурсных узлах распределенных сред // 3-я Межд. науч. конф. «Суперкомпьютерные системы и их применение». SSA’2010. Минск, 2010. 2. 12-16.
  4. Варламов Д.А., Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф. Виртуализация вычислительной среды в ГРИД // «Параллельные вычислительные технологии 2010» (ПаВТ-2010), Уфа, март 2010. Челябинск: Изд-во ЮУрГУ, 2010. 63-70.
  5. Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф., Варламов Д.А., Волохов А.В. Новые методы решения задач вычислительной химии в распределенных средах // «Научный сервис в сети Интернет: суперкомпьютерные центры и задачи.’’ 20-25 сентября 2010, Новороссийск. М.: Изд-во Моск. гос. ун-та, 2010. 181-184.
  6. Волохов В.М., Пивушков А.В., Волохов А.В., Варламов Д.А. Реализация нескольких независимых ресурсных грид-сайтов на едином физическом пространстве кластера // X Межд. конф. «Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах». HPC-2010. Пермь, 2010. 1. 119-124.

Загрузки

Опубликован

31-10-2011

Как цитировать

Волохов В., Варламов Д., Пивушков А., Сурков Н., Варламов Д. Динамически формируемые параллельные среды в условиях грид-полигоноа: проблемы и решения // Вычислительные методы и программирование. 2011. 12. 39-45

Выпуск

Раздел

Раздел 2. Программирование