Увеличение размерности в методе докинга на основе тензорных поездов
Желтков Д.А., Тыртышников Е.Е.

Предложена модификация метода докинга на основе тензорных поездов с использованием идеи искусственного увеличения размерности при поиске положения молекулы-лиганда, минимизирующего энергию системы белок–лиганд. Проведено сравнение с программой TTDock (докинг на основе тензорных поездов), не использующей искусственное увеличение размерности. Результаты тестирования показывают, что при той же надежности предложенная модификация в 5–10 раз вычислительно менее затратна, чем TTDockю

Ключевые слова: тензорный поезд, искусственное увеличение размерности, крестовый метод, глобальная оптимизация, докинг, компьютерный дизайн лекарств

Название статьи, аннотация и ключевые слова на английском языке

Желтков Д.А., аспирант, e-mail: dmitry.zheltkov@gmail.com; – Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики, Ленинские горы, д. 1, стр. 52, 119992, Москва;
Тыртышников Е.Е., директор, e-mail: eugene.tyrtyshnikov@gmail.com – Институт вычислительной математики РАН, ул. Губкина, д. 8, 119333, Москва