TTDock: метод докинга на основе тензорных поездов
Желтков Д.А., Офёркин И.В., Каткова Е.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Тыртышников Е.Е.

Разработан метод докинга на основе тензорных поездов, позволяющий с высокой вероятностью найти положение, в котором достигается глобальный минимум энергии системы белок-лиганд. Полученный метод сравнивается с одним из наиболее эффективных методов докинга на основе генетических алгоритмов SOL. Результаты тестирования показывают, что метод на основе тензорных поездов в 10 раз менее затратен при сопоставимой надежности получения глобального оптимума энергии.

Ключевые слова: тензорный поезд, крестовый метод, глобальная оптимизация, докинг, компьютерный дизайн лекарств

Название статьи, аннотация и ключевые слова на английском языке

Желтков Д.А., аспирант, e-mail: dmitry.zheltkov@gmail.com; – Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики, Ленинские горы, д. 1, стр. 52, 119992, Москва;
Офёркин И.В., программист, e-mail: io@dimonta.com;   Каткова Е.В., мл. науч. сотр., e-mail: katkova@dimonta.com;   Сулимов А.В., системный программист, e-mail: sulimovv@mail.ru – ООО "Димонта", ул. Нагорная, д. 15, корп. 8, 117186, Москва;
Сулимов В.Б., зав. лабораторией, e-mail: vladimir.sulimov@gmail.com – Научно-исследовательский вычислительный центр, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Ленинские горы, д. 1, стр. 4, 119992, Москва;
Тыртышников Е.Е., директор, e-mail: eugene.tyrtyshnikov@gmail.com – Институт вычислительной математики РАН, ул. Губкина, д. 8, 119333, Москва