Организация квантовохимических расчетов с использованием пакета Firefly в гетерогенной грид-системе на базе BOINC

Авторы

  • Н.Н. Никитина Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра РАН (ИПМИ КарНЦ РАН)
  • Е.Е. Ивашко Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра РАН (ИПМИ КарНЦ РАН)

Ключевые слова:

BOINC, Firefly, распределенные вычисления, грид

Аннотация

Рассмотрен опыт проведения большого числа вычислительных экспериментов на базе гетерогенной грид-системы под управлением программной платформы BOINC. Для проведения квантовохимических расчетов использован программный пакет Firefly, адаптированный для выполнения в распределенной среде с помощью программы-«обертки» GenWrapper. Постановка заданий производилась через специальный web-интерфейс доступа к грид-сегменту.

Авторы

Н.Н. Никитина

Е.Е. Ивашко

Библиографические ссылки

  1. Kamra V., Chugh A. TCP/IP security protocol suite for grid computing architecture // Communications in Computer and Information Science. 2011. Part 1. 169. 30-35.
  2. Foster I., Kesselman C. The grid: blueprint for a new computing infrastructure. San Francisco: Morgan Kaufmann Publishers, 2004.
  3. Condor. High Throughput Computing (http://www.cs.wisc.edu/condor).
  4. The Globus Toolkit (http://www.globus.org/toolkit).
  5. UNICORE - Distributed Computing and Data Resources (http://www.unicore.eu).
  6. BOINC: Программное обеспечение с открытым исходным кодом для организации добровольных распределенных вычислений и распределенных вычислений в сети (http://boinc.berkeley.edu/index.php).
  7. Семейство программ X-Com (http://x-com.parallel.ru/).
  8. Центр высокопроизводительной обработки данных ЦКП КарНЦ РАН. Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра РАН (http://cluster.krc.karelia.ru).
  9. Проект добровольных вычислений Climateprediction.net (http://climateprediction.net).
  10. Проект добровольных вычислений SETI@home (http://setiathome.berkeley.edu).
  11. Проект добровольных вычислений Einstein@home (http://einstein.phys.uwm.edu).
  12. Marosi A.C., Balaton Z., Kacsuk P. GenWrapper: a generic wrapper for running legacy applications on desktop grids // 3rd Workshop on Desktop Grids and Volunteer Computing Systems (PCGrid 2009). Rome, 2009.
  13. Granovsky A.A. Firefly version 7.1.G (http://classic.chem.msu.su/gran/firefly/index.html).
  14. Schmidt M.W., Baldridge K.K., Boatz J.A., Elbert S.T., Gordon M.S., Jensen J.H., Koseki S., Matsunaga N., Nguyen K.A., Su S., Windus T.L., Dupuis M., Montgomery J.A. General atomic and molecular electronic structure system // J. Comput. Chem. 1993. 14. 1347-1363.
  15. Кременецкий В.Г., Кременецкая О.В., Кузнецов С.А., Калинников В.Т. Квантово-химический подход к оценке состава устойчивых комплексных частиц в расплавах галогенидов щелочных металлов // Докл. РАН. 2011. 437, № 6. 782-784.
  16. Stulov Yu.V., Kremenetsky V.G., Kremenetskaya O.V., Fofanov A.D., Kuznetsov S.A. Standard rate constants of charge transfer for the redox couple Cr(III)/Cr(II) in chloride melts: experiment and calculation // Proc. 9th Int. Frumkin Symp. Electrochemical Technologies and Materials for XXI Century. Moscow, 2010.

Загрузки

Опубликован

23-09-2012

Как цитировать

Никитина Н., Ивашко Е. Организация квантовохимических расчетов с использованием пакета Firefly в гетерогенной грид-системе на базе BOINC // Вычислительные методы и программирование. 2012. 13. 8-12

Выпуск

Раздел

Раздел 2. Программирование