Расчеты взаимодействий в биомолекулярных системах: сравнение квантовых и классических подходов
Бажанова З.Г., Хренова М.Г., Немухин А.В.

Рассматриваются методические вопросы применения методов молекулярной механики, квантовой химии и комбинированного метода квантовой механики/молекулярной механики (КМ/ММ) к расчетам межмолекулярных взаимодействий ряда аминокислот (аргинина, гистидина и серина) с молекулами воды. Расчеты выполнены на суперкомпьютере СКИФ МГУ "Чебышёв" с использованием приближений теории функционала электронной плотности в квантовых подсистемах. По результатам расчетов сформулированы практические рекомендации для оценок энергетической стабильности межмолекулярных комплексов. Работа выполнена при поддержке РФФИ (код проекта 10-01-00297а).

Ключевые слова: квантово-химические расчеты, метод КМ/ММ, межмолекулярные взаимодействия

Название статьи, аннотация и ключевые слова на английском языке

Бажанова З.Г., ст. науч. сотр., e-mail: bazhanov@srcc.msu.ru; - Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр, Ленинские горы, 119991, Москва;
Немухин А.В., профессор, зав. лаб., e-mail: anemukhin@yahoo.com;   Хренова М.Г., мл. науч. сотр., e-mail: wasabiko13@gmail.com - Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, химический факультет, Ленинские горы, 119991, Москва